MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 93958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_015564	CA	3	6	52170	52175	50 %	0 %	0 %	50 %	333917726
1003	NC_015564	CGA	2	6	52198	52203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917726
1004	NC_015564	GGC	2	6	52220	52225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917726
1005	NC_015564	ACC	2	6	52228	52233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917726
1006	NC_015564	TCG	2	6	52321	52326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917726
1007	NC_015564	GCA	2	6	52393	52398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917726
1008	NC_015564	CCG	2	6	52434	52439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917726
1009	NC_015564	CG	3	6	52447	52452	0 %	0 %	50 %	50 %	333917726
1010	NC_015564	AGC	2	6	52486	52491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917726
1011	NC_015564	GAC	2	6	52518	52523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917726
1012	NC_015564	GGC	2	6	52554	52559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917726
1013	NC_015564	CAT	2	6	52568	52573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917726
1014	NC_015564	GCC	2	6	52602	52607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917726
1015	NC_015564	GAC	2	6	52608	52613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917726
1016	NC_015564	CGG	2	6	52622	52627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917726
1017	NC_015564	TGA	2	6	52687	52692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917727
1018	NC_015564	GCC	2	6	52711	52716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917727
1019	NC_015564	CCT	3	9	52770	52778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917727
1020	NC_015564	CGGAG	2	10	52807	52816	20 %	0 %	60 %	20 %	333917727
1021	NC_015564	CGC	2	6	52854	52859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917727
1022	NC_015564	CGG	2	6	52866	52871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917727
1023	NC_015564	CAG	2	6	52911	52916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917727
1024	NC_015564	GCT	2	6	52949	52954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917727
1025	NC_015564	GTC	2	6	53002	53007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917727
1026	NC_015564	CTTCCA	2	12	53106	53117	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	333917727
1027	NC_015564	GGCG	2	8	53161	53168	0 %	0 %	75 %	25 %	333917727
1028	NC_015564	TCA	2	6	53184	53189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917727
1029	NC_015564	CGA	2	6	53196	53201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917727
1030	NC_015564	CA	3	6	53211	53216	50 %	0 %	0 %	50 %	333917727
1031	NC_015564	ACG	2	6	53227	53232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917727
1032	NC_015564	CGC	2	6	53316	53321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917728
1033	NC_015564	GC	3	6	53329	53334	0 %	0 %	50 %	50 %	333917728
1034	NC_015564	GTC	2	6	53338	53343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917728
1035	NC_015564	CG	3	6	53352	53357	0 %	0 %	50 %	50 %	333917728
1036	NC_015564	TAG	2	6	53361	53366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917728
1037	NC_015564	CTC	2	6	53434	53439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917728
1038	NC_015564	ACG	2	6	53450	53455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917728
1039	NC_015564	GCC	2	6	53477	53482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917728
1040	NC_015564	GT	3	6	53493	53498	0 %	50 %	50 %	0 %	333917728
1041	NC_015564	CCAG	2	8	53632	53639	25 %	0 %	25 %	50 %	333917728
1042	NC_015564	TCGG	2	8	53714	53721	0 %	25 %	50 %	25 %	333917728
1043	NC_015564	GCC	2	6	53746	53751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917728
1044	NC_015564	GC	3	6	53784	53789	0 %	0 %	50 %	50 %	333917728
1045	NC_015564	AGCG	2	8	53791	53798	25 %	0 %	50 %	25 %	333917728
1046	NC_015564	CGC	2	6	53824	53829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917728
1047	NC_015564	GCAG	2	8	53846	53853	25 %	0 %	50 %	25 %	333917728
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1050	NC_015564	GAG	2	6	54090	54095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917729
1051	NC_015564	GC	3	6	54098	54103	0 %	0 %	50 %	50 %	333917729
1052	NC_015564	CAG	2	6	54105	54110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917729
1053	NC_015564	GCA	2	6	54127	54132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917729
1054	NC_015564	CGC	2	6	54138	54143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917729
1055	NC_015564	CGC	3	9	54165	54173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917729
1056	NC_015564	GAC	2	6	54180	54185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917729
1057	NC_015564	CCA	2	6	54264	54269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917729
1058	NC_015564	GCC	2	6	54357	54362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917729
1059	NC_015564	GCG	2	6	54376	54381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917729
1060	NC_015564	CGC	2	6	54390	54395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917729
1061	NC_015564	AC	3	6	54396	54401	50 %	0 %	0 %	50 %	333917729
1062	NC_015564	CGC	3	9	54552	54560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917730
1063	NC_015564	CTG	2	6	54635	54640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917730
1064	NC_015564	TTC	2	6	54651	54656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917730
1065	NC_015564	TCG	2	6	54747	54752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917730
1066	NC_015564	GC	5	10	54770	54779	0 %	0 %	50 %	50 %	333917730
1067	NC_015564	TCG	2	6	54783	54788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917730
1068	NC_015564	GCG	2	6	54801	54806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917730
1069	NC_015564	CGA	2	6	54862	54867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917730
1070	NC_015564	GC	3	6	54911	54916	0 %	0 %	50 %	50 %	333917730
1071	NC_015564	CTGCG	2	10	54975	54984	0 %	20 %	40 %	40 %	333917730
1072	NC_015564	CTG	2	6	54992	54997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917730
1073	NC_015564	GCC	2	6	55307	55312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917731
1074	NC_015564	GCG	2	6	55365	55370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917731
1075	NC_015564	TGCCG	2	10	55371	55380	0 %	20 %	40 %	40 %	333917731
1076	NC_015564	CGTCAG	2	12	55390	55401	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333917731
1077	NC_015564	TGA	2	6	55439	55444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917731
1078	NC_015564	CAC	2	6	55453	55458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917731
1079	NC_015564	GAC	2	6	55507	55512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917731
1080	NC_015564	GTG	2	6	55622	55627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917731
1081	NC_015564	ATC	2	6	55639	55644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917731
1082	NC_015564	GTG	2	6	55645	55650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917731
1083	NC_015564	CGC	2	6	55691	55696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917731
1084	NC_015564	CAGT	2	8	55740	55747	25 %	25 %	25 %	25 %	333917731
1085	NC_015564	GCT	2	6	55782	55787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917731
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1087	NC_015564	ACG	2	6	55838	55843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917731
1088	NC_015564	CG	3	6	55917	55922	0 %	0 %	50 %	50 %	333917731
1089	NC_015564	ACCG	2	8	55927	55934	25 %	0 %	25 %	50 %	333917731
1090	NC_015564	TCA	2	6	55943	55948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917731
1091	NC_015564	TG	3	6	55994	55999	0 %	50 %	50 %	0 %	333917731
1092	NC_015564	GTG	2	6	56001	56006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917731
1093	NC_015564	GCAG	2	8	56067	56074	25 %	0 %	50 %	25 %	333917731
1094	NC_015564	ACC	2	6	56098	56103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917731
1095	NC_015564	CGA	2	6	56106	56111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917731
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1097	NC_015564	GC	3	6	56234	56239	0 %	0 %	50 %	50 %	333917731
1098	NC_015564	TCGATA	2	12	56258	56269	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333917731
1099	NC_015564	CTG	2	6	56311	56316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917731
1100	NC_015564	C	6	6	56332	56337	0 %	0 %	0 %	100 %	333917731
1101	NC_015564	CGC	2	6	56428	56433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917731
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1103	NC_015564	GCT	2	6	56499	56504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917731
1104	NC_015564	GTGG	2	8	56583	56590	0 %	25 %	75 %	0 %	333917731
1105	NC_015564	GAA	2	6	56643	56648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917731
1106	NC_015564	GAC	2	6	56788	56793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917731
1107	NC_015564	TGC	2	6	56810	56815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917731
1108	NC_015564	CGA	2	6	56859	56864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917731
1109	NC_015564	CCA	2	6	56913	56918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917732
1110	NC_015564	CGA	2	6	56931	56936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917732
1111	NC_015564	TTC	2	6	57073	57078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917732
1112	NC_015564	GCCGA	2	10	57260	57269	20 %	0 %	40 %	40 %	333917733
1113	NC_015564	CGC	2	6	57294	57299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917733
1114	NC_015564	CGT	2	6	57478	57483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917733
1115	NC_015564	CCA	2	6	57485	57490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917733
1116	NC_015564	TGA	2	6	57507	57512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917733
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1118	NC_015564	CG	4	8	57681	57688	0 %	0 %	50 %	50 %	333917733
1119	NC_015564	AGCC	2	8	57714	57721	25 %	0 %	25 %	50 %	333917733
1120	NC_015564	ACCGC	2	10	57731	57740	20 %	0 %	20 %	60 %	333917733
1121	NC_015564	GCGA	2	8	57746	57753	25 %	0 %	50 %	25 %	333917733
1122	NC_015564	CCG	2	6	57773	57778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917733
1123	NC_015564	GGAT	2	8	57782	57789	25 %	25 %	50 %	0 %	333917733
1124	NC_015564	GCA	2	6	57807	57812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917733
1125	NC_015564	AGC	2	6	57911	57916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917733
1126	NC_015564	TCA	2	6	57921	57926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917733
1127	NC_015564	TCA	2	6	57960	57965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917733
1128	NC_015564	TCG	2	6	58028	58033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917733
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1130	NC_015564	GCC	2	6	58096	58101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917733
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1139	NC_015564	TCA	2	6	58377	58382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917733
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1146	NC_015564	CCAT	2	8	59008	59015	25 %	25 %	0 %	50 %	333917734
1147	NC_015564	ATC	2	6	59053	59058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917734
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1149	NC_015564	CGA	2	6	59168	59173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917734
1150	NC_015564	TGC	2	6	59223	59228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917734
1151	NC_015564	CATGC	2	10	59238	59247	20 %	20 %	20 %	40 %	333917734
1152	NC_015564	GTC	2	6	59343	59348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917734
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1237	NC_015564	ATCGG	2	10	63462	63471	20 %	20 %	40 %	20 %	333917738
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1240	NC_015564	GGTG	2	8	63521	63528	0 %	25 %	75 %	0 %	333917738
1241	NC_015564	GA	3	6	63539	63544	50 %	0 %	50 %	0 %	333917738
1242	NC_015564	GTC	2	6	63552	63557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917738
1243	NC_015564	TGG	2	6	63631	63636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917738
1244	NC_015564	TCG	2	6	63643	63648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917738
1245	NC_015564	CAG	2	6	63658	63663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917738
1246	NC_015564	CGT	3	9	63671	63679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917738
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1499	NC_015564	TTG	2	6	74968	74973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917754
1500	NC_015564	GC	4	8	74992	74999	0 %	0 %	50 %	50 %	333917754

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